行政院在2001年8月2日在屏東舊紙漿廠辦公室由前院長張俊雄揭牌成立「高屏溪流域管理委員會」，成為全國第一個以流域管理觀念成立的溪流專責機構，該委員會未來將成立高屏溪流域管理局，將在7年內投入近800億元，改善南台灣高屏溪的水質、水量，並聯合官方、民間力量聯防巡防大隊，進行24小時全面稽查，杜絕各種水域汙染，早日改善南台灣嚴重的用水問題。

高屏溪總長一百七十一公里，流域面積三千二百五十七公里，為高雄縣市近兩百六十萬人口的飲水來源。管理委員會成立後，將承接有關高屏溪所有相關事務，以維護水源、水質及水量為第一要務。

委員會由官方、民間成立的108人稽查大隊，全力執行高屏溪主支流河川區域違規案件巡查工作，為加強民眾參與檢舉工作，特別設置免付費檢舉電話0800-800-995及傳真檢舉電話(08)7515574，供民眾24小時檢舉違規案件。