每年九月二十八日「至聖先師孔子誕辰紀念」在孔廟所舉行的祭孔大典，是孔廟最熱鬧，也是最為人注目的日子。

　　

　　目前祭孔大典的樂典、佾舞都是參考明朝南雍志的「文武圖譜」及明朝李文藻的「類官禮樂疏」而制定。樂器為周制宋式，服飾則參考宋、明服飾以新法裁制而成。到祭孔大典那天，要在神前擺上籩豆、幣帛、香燭等，供品非常豐富，供禮擺好後，以鳴炮作為典禮的開始，此時身穿禮服與祭的各官民，都要各就各行釋奠之禮，跳八俏舞，奏雅樂。其次更奏迎神之樂，並由主祭官朗讀祭文。

　　祭孔大典時，禮生的服裝顏色是紫色，樂生是紅色，佾生是黃色。 明朝時認為此三色搭配最適合，最醒目。其配件有衣(穿衣)、褲(穿褲)、鞋子(納履)、帽子(戴冠)、腰帶(繫帶)及領巾(中單)﹝左上右下﹞等六件。

　　佾生通常是以小朋友為主，年紀較小，所以需由旁人指導協助其穿著，以避免脫落或衣冠不整，影響典禮觀瞻。 以前佾生都是由男生擔任，83年陸續有女生擔任佾生的演出，至今女生的佾生比男生還多。

　　主祭官讀完祭文後，與祭的文官官員和文人學者要行三跪九叩禮，其間會演奏各種舞樂，叫作「佾舞」。佾舞的每一個動作，都是專家模仿「類官禮樂疏」中的明朝圖譜而來，主要是身體和手的動作。祭典開始，首先由樂生敲響置於儀門西側的晉鼓，鼓聲輕重有致，由緩而急，由弱轉強，而漸湲漸弱，至於無聲後，再重擊鼓心一響。

　　當鼓聲再響起，穿著黃袍的佾生和紫袍的樂生，以及執事依序於兩廁，準備人場。鼓二嚴、樂生、佾生、執事踏著建鼓的節奏，魚員入場。糾儀官、陪祭官分獻官也在「引贊」的引導下陸續就位，最後就位的是正獻官。大成殿對面經常關閉著的儀門及櫺星門，此時由執事人員一一打開，禮生高舉著盛裝「太牢」（牛、羊、豕三牲）的器皿，由大成殿下階梯，過庭經儀門櫺星門，當門偏西掘土，將毛血埋在土中，以告神靈，這個儀式叫做「毛血」。接著就要「迎靈」。樂聲奏起「咸和之曲」。與會人士個個摒息恭迎，待樂聲停止，全體虔誠地行三鞠躬禮，然後進撰、上香。此時進入祭典的最高潮，樂聲、歌聲並起。正獻官、分獻官分別致各殿獻帛、獻帛，再行鞠躬之禮。

　　三獻完畢，總代表上香，恭讀祝文，然後奉祀官上香（孔子七十七代孫）。正獻官復位後，儀門及櫺星門再度關上，直到下一年祭孔大典時再打開。隨後，正獻官、分獻官、樂生及佾生便相繼退下，祭孔大典至此宣告結束。

　　這時旁觀的民眾紛紛進入祭壇內搶拔祭祀牛頭上的「智慧毛」，不過近年來，改以取「智慧水」，及發「智慧糕」來替代，一樣達到增加智慧的象徵意思。